化学能的本质和机理究竟是什么?

载体当然是光子，所以你会看到反应放热或吸热。
电子的转移和得失，更确切的说法是电子云的合并。你知道，原子核在电子云中小到可以忽略。
除了恒星、核弹以及放射性同位素衰变，我们整个宇宙的其他能量转换，都是电磁辐射，也就是光子。
引力场的势能，最终也变成热辐射。
如果说电子云吃光子的细节，电子云是带电荷的，所以当光子碰到电子的时候，电子的电荷会受光子，也就是一个电磁场变化量，的影响，从而加速电子的运动，改变其轨道势能。同时光子失去能量。
你说的ATP，是在一个叫膦酸什么什么活化酶的作用下，相当于自己手里抱着一个活跃电子（高能化的键），然后递给别的分子。使用这个电子的最终消费者，通常是利用这个高能键改变自己形状的某种蛋白质，从而利用化学键的吸引力，像弹簧一样工作，实现电子势能和机械能的转化。如果这叫巧妙的话，叶绿体就是魔术。
叶绿体人家是利用量子原理构造出离子阱捕获光子，然后吸收其能量后，在另一端的平台上合成糖。可惜转换效率不够动物的功率，哈哈。

众所周知，伴随着电子的得失与转移，化学键会出现结合或断裂，在此过程中会出现释放化学能与吸收化学能的作用，但是，对其这种能量发生的机理及其实质似乎所能找到的论述甚少，譬如，当一个高能态化学键断裂然后重新形成低能态化学键的过程中所释放出的能量，究竟这个所释放出的能量载体是什么？（或者说，这种所释放出的能量，究竟是什么粒子的运动？，又是如何被其他物质所接收的？，
我们讲围绕任何能量的背后，都必定存在物质的运动，而任何能量的转移与转化，都必然伴随着物质之间的相互作用，那么ATP水解反应中所释放出的化学能究竟是以什么粒子的运动为载体的呢？是什么粒子的什么运动，然后通过什么相互作用来对外做功？并进而将能量转移/转化到了其他物质上？
能量是衡量物质做功潜力的一个量度。不考虑宏观和微观，能量我觉得可以分为两种，动能和势能。动能即运动着的物质所具有的能量，包括宏观物质的动能和分子动能（内能的一部分）。另外就是势能，两个物质对象，由于处在互相作用力场中的位置可具有的做功的潜力。宏观的电势能，重力势能，微观如分子势能（内能的一部分），核能（强相互作用势能）。所以我觉得化学能应该是分子体系间包括分子体系内部（外层电子和原子核）之间所具有电磁力势能。ATP水解释放化学能，是ATP水解前具有的化学能，转化为ATP水解后其他形式的能（主要为热能）。释放化学能不是放出来化学能，而是以化学能减少的代价转化为别的能的增加。化学能的载体就是ATP分子体。系与水分子体系之间的电磁势能。所转化成的动能的载体，那就是反应物自身了，分子热运动加剧，，
还有，我觉得任何能量的背后都有物质的运动这句话是不对的，势能就没有对应运动啊。具有势能的物质运动了（在其势能对应的作用力场中位置变化），是势能减少转为动能的过程，而非势能本身对应的。

从质能关系的角度讲，所有亏掉的的化学能都是质量。
举个例子，氢分子的质量略小于两个无关联氢原子的质量和，差值所对应的几乎就是键能。
通俗点说，可能略微不准确，化学键断裂吸热不放热，成键放热，断键吸热，能量载体主要有两种，一是动能，造成粒子的震动，表现为热和温度，另一种是电磁辐射，例如可见光和红外线，当粒子与粒子近距离接触，动能发生传递，所以两个温度不同的物体接触温度会发生改变，粒子吸收了电磁辐射，尤其是红外线，也会产生动能发生震动，温度升高，此外还有别的能量转换，例如电能，或者新的化学能，在这里就不多说了。

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